朱熹是宋代理学大师，也是宋易中义理学派的集大成者。他提出“易只是一阴一阳”的命题，强调阴阳变易是《周易》的基本法则，认为一切事物的存在及其变化，归根到底，无非是一阴一阳，就卦爻象的变化说，整部{周易)不过是一个阴阳奇偶，有奇偶两画相交相推，方在六十四卦象，方有易之变易，若没有奇偶卦画，凭什么写出那{周易》的阴阳造化，又哪里去得其变易?也就是说，卦爻象的变易无非一阴一阳卦画的相互推移。就阴阳之气的变化说，气的变化有进有退，有消有长，也是一阴一阳，万物万事都依此消长变易而出，所以个体事物的存在及变化也是一阴一阳。天地之间，无一物不有阴阳乾坤，以至于至微至细， 草木禽兽，也有牝牡阴阳。这是将事物的变易归结为阴阳变易，是对以前阴阳说的发挥。
    由此，朱熹进一步研究了事物变易的法则，特别是阴阳二气变易的法则。他认为，阴阳变易的法则有二：一是流行，即推移，如阳变阴，阴变阳，动变为静，静变为动，昼夜寒暑，屈伸往来。二是对待，即交错，如天地定位，山泽通气，阳中有阴，阴中含阳。前者指阴阳对立面相互转化，后者指对立面相互渗透。有对待方有渗透，而对待意味着阳是阳，阴是阴，各居其位，不相混淆，所以他又称交错对待为阴阳“有个定位底”。值得注意的是，朱氏以“一气”说明流行，以“二气”说明对待。这种观点，又含有对立统一的因素。
    关于阴阳流行，朱熹主一气说，认为阴阳的推移，乃一气之消长，阴阳•只是一气，长时为阳，消时为阴。阳的一面发展到顶点便开始消退，即转化为阴气，不是说阳气尽了，又另外有一个阴气出来代替它。正如人的呼吸只是一气之呼吸，呼时为阳，吸时为阴，这是以一气自身的转化说明事物的盈虚盛衰，突破了汉唐易学的二气轮替说。此种观点意味着一事物在其变化过程中自身具有矛盾的同一性，所谓流转，不是二物更替，而是一物之分化，是对对立面转化学说的新阐发。朱熹又认为，此阴阳流行的过程，总是阳了又阴，阴了又阳，循环不已，既没有千个开头，也没有终结。整个物质世界的变化也是如此。现在的世界只是阴阳流转过程中的一个阶段，在此天地之前已有一番天地，此天地毁灭了，仍然另有一天地，其前无始，其后无终。他经常引用程颐的名言对此加以论证，如说：“程子云：动静无端，阴阳无始。此语见得分明。今高山上多有石上蛎壳之类，是低处成高。又蛎须生于泥沙中，今乃在石山，则为柔化为刚，天地变迁，何常之有。”(《朱子语类》卷九十四)这是依据当时的地质学知识，高山上有贝壳化石，说明当年此地为河海，进而论证我们所处的世界是一个阴阳流转的过程，从而推论整个宇宙也是阴阳阖辟连续不断的过程。此种观点，既肯定了物质世界的变化是对立面转化的过程，又认为无论如何转化，阴阳二气作为世界构成的要素，不被创造，也不消灭。这是朱熹阴阳学说的一个贡献。同时，他还认为，阴阳流行具有两种形式，即渐化和顿变。所谓：“化是渐渐化尽，以至于无。变则骤然而长。”(《朱子语类》卷七十四)“化是渐化”，“变是顿断”(同上，卷七十五)。甚至认为顿变并非突然而成，阴阳的消长必须经过渐化即量的积累过程。如一年的小雪节过后，阳气便一日生一分，到十一月半冬至，一阳始成，又如怀胎十月，方成个儿子。此种学说，是强调对立面转化必须经过量的积累，这在中国思想史上，也是一种新的观点。
    关于阴阳对待，朱熹又提出了阴阳各生阴阳说。
    他认为，万事万物各分阴阳，一事一物又有其阴阳，如人之男女为阴阳，一人之身上又各有血气，血阴而气阳；又如昼夜之间，昼阳而夜阴，但昼阳自中午以后又属阴，夜阴自子夜之后又屑阳。如此阳中有阴，阴中又有阳，阴阳交错对待，便是“阴阳各生阴阳”。比如生死，生为阳，死为阴，但生死之中又有阴阳，精气为物为生，精则属阴，气则属阳。人身之生气为阳，其体魄为阴。生命为阳，但又带个死的道理，这又是阳中有阴；死亡为阴，其魂气游散上升，又是阴中有阳。
    朱熹此说，在于说明卦象和事物的对立是错综复杂的，对立面是由许多层次构成的，不能将{易传》所说的“分阴分阳”简单化。此种观点，又含有对立面相互渗透，或肯定中包含否定的因素。这是朱熹阴阳说的又一贡献。
    总起来说，朱熹的阴阳流行和阴阳对待说，对事物变易的过程和形式作了许多有价值的概括，丰富和发展了前人的阴阳观，闪烁着辩证思维的光芒，然而，应该指出，由于区分形而上和形而下两个世界，认为阴阳流行和对待之事，皆出于其理之当然，而形而上的理世界只有对待，其自身并无变易，永恒如此。于是，又将对立的性质凝固化，导出了阴阳定位不移说，以为个体事物和阴阳二气，其屈伸往来，虽然流行不已，但其本质和关系却定位不移，万古如是。这又陷入了形而上学。‘朱熹的阴阳流行和朋阳对待说，后来被明代的蔡清和来知德作了详细阐发，在易学史上产生了深刻的影响。